УДК 636.4:636.018:575.162
doi: 10.15389/agrobiology.2015.6.736rus
АССОЦИАЦИЯ ГЕНА IGF2 С ПРОДУКТИВНЫМИ КАЧЕСТВАМИ
СВИНЕЙ (Sus scrofa) КРУПНОЙ БЕЛОЙ ПОРОДЫ С УЧЕТОМ
ПОЛОВОЙ ДИФФЕРЕНЦИАЦИИ
О.В. КОСТЮНИНА1, С.С. КРАМАРЕНКО2, Н.А. СВЕЖЕНЦЕВА1,
Е.И. СИЗАРЕВА1, Н.А. ЗИНОВЬЕВА1
Маркерная селекция — перспективный подход для улучшения хозяйственно полезных признаков домашних животных. В качестве одного из потенциальных генетических маркеров мясных и откормочных качеств свиней рассматривается ген инсулиноподобного фактора роста 2 (IGF2). Целью настоящей работы стало исследование полиморфизма G3072A в гене IGF2 у свиней различных пород и изучение влияния генотипа хряков по IGF2 на продуктивные показатели у потомков с учетом их половой принадлежности на примере крупной белой породы. Полиморфизм IGF2 исследовали у 3215 свиней семи пород — крупная белая и родственные ей породы йоркшир и эдельшвайн (КБ, n = 1247), ландрас (Л, n = 934), дюрок (Д, n = 642), пьетрен (П, n = 87), белорусская мясная (БМ, n = 37), ливенская (ЛИВ, n = 54), эстонская беконная (ЭБ, n = 10), а также у синтетической линии боди (БД, n = 138) и одного терминального кросса (ТМ, n = 66). Для ассоциативных исследований использовали данные по показателям продуктивности у 5908 потомков (5015 свинок и 893 хрячка, крупная белая порода), полученных от хряков (n = 20) с известным генотипом по IGF2. Учитывали живую массу по завершении выращивания (BW, кг); среднесуточный прирост за весь срок (DG, г) и по периодам выращивания: ранний период — от рождения до 76,41±0,04 сут (DG1, г) и поздний период — от 76,41±0,04 до 170,23±0,05 сут (DG2, г); возраст достижения массы 100 кг (AGE100kg, сут); среднюю фактическую толщину шпика, измеренную по четырем точкам по завершении выращивания (BF, мм), и толщину шпика, приведенную к 100 кг (BF100kg, мм). Достоверно более высокие частоты потенциально желательного аллеля А и генотипа АА выявлены у БД (соответственно 0,986 и 0,971), ТМ (0,977 и 0,955), П (0,966 и 0,931) и Д (0,960 и 0,921). Свиньи КБ характеризовались промежуточными значениями этих показателей (0,664 и 0,532). У ЭБ, БМ и Л частота аллеля A варьировала от 0,250 до 0,363, генотипа АА — от 0,100 до 0,243. У локальной породы ЛИВ аллель А идентифицирован не был. По результатам ассоциативных исследований установлена высокодостоверная тенденция к повышению BW, DG1, DG2, DG, BF и BF100kg и снижению AGE100kg как у свинок, так и у хрячков в ряду генотипов GG → AG → AA. Расчеты с использованием аддитивно-доминантной модели и двухфакторного дисперсионного анализа свидетельствовали, что интенсивность возрастания (снижения) перечисленных выше показателей в ряду генотипов GG → AG → AA среди хрячков выше, чем среди свинок. Согласно результатам анализа главных компонент (ГК, PCA), первые две ГК (ГК1 и ГК2) описывали 76,23 % изменчивости исходной матрицы для хрячков и 82,49 % — для свинок. Выявлена сильная связь ГК1 с приростом живой массы в поздний срок (для DG2 r = 0,501 у хрячков и r = 0,896 — у свинок) и за весь период выращивания (для DG r = 0,923 и r = 0,929), в то время как ГК2 сильно коррелировала с приростом живой массы в ранний период (для DG1 r = -0,709 и r = -0,769). Показатели аддитивно-доминантной (А и D) модели и эффекты замены аллеля, рассчитанные для ГК1, оказались полностью сходными и не зависели от пола: А = 0,290, p < 0,001; D = -0,064 — у свинок и А = 0,351, p < 0,001; D = 0,040 — у хрячков. Для ГК2 у хрячков достоверная оценка была получена для доминантной компоненты (А = 0,085; D = 0,177, p < 0,05), в то время как у свинок — для аддитивной (А = 0,094, p < 0,001; D = -0,031). Наши данные о количественном влиянии генотипа по IGF2 на показатели мясной и откормочной продуктивности свиней, а также выявленное влияние пола на проявление действия маркерных генотипов по периодам выращивания следует учитывать при разработке программ маркерной селекции с использованием IGF2.
Ключевые слова: свиньи, Sus scrofa, крупная белая, популяция, откормочные качества, QTL, ПЦР, мутация, IGF2.
O.V. Kostyunina1, S.S. Kramarenko2, N.A. Svezhentseva1, E.I. Sizareva1,
N.A. Zinovieva1
Marker-assisted selection is an attractive way to improve the economically important traits in domestic animals and particularly in pigs. Insulin-like growth factor 2 (IGF2) is one of the potentially important genetic marker for growth and carcass traits of pigs. The objective of our work was to study G3072A polymorphism of IGF2 gene in different pig breeds and to evaluate the effect of boar genotypes on productive traits of their offspring of different sexes. IGF2 polymorphism was studied in seven pig breeds including large white and their close related breeds Yorkshire and Edelswine (LW, n = 1247), Landrace (L, n = 934), Duroc (D, n = 642), Pietrain (P, n = 87), Belorussian meat (BM, n = 37), Liven (LIV, n = 54), Estonian beckon (EB, n = 10), one synthetic line Body (BD, n = 138) and one terminal cross (TM, n = 66). Association studies were performed using data records of 5908 offspring (including 5015 gilts and 893 young boars) produced from twenty LW boars with known genotype for IGF2. The following productive traits were evaluated: body weight at the end of growing period (BW, kg), daily gain during entire growing period (DG, g), daily gain during early period from birth to 76.41±0.04 days (DG1, g), daily gain during late period from 76.41±0.04 to 170.23±0.05 (DG2, g); the age at 100 kg (AGE100kg, days), average actual back fat thickness measured in four points at the end of growing period (BF, mm) and average back fat thickness calculated for the 100 kg body weight (BF100kg, mm). Significantly higher frequencies of the potentially «desired» A allele and AA genotype were observed in BD (0.986 and 0.971, respectively), ТМ (0.977 and 0.955), P (0.966 and 0.931) and D (0.960 and 0.921). LW pigs were characterized by the intermediate values of allele A (0.664) and genotype AA frequencies (0.532). In EB, BM and L the frequencies of A allele and AA genotype varied from 0.250 to 0.363 and from 0.100 to 0.243, respectively. We did not identify A allele in local Russian LIV pig breed. Association studies showed high-significant tendency to increase of BW, DG1, DG2, DG, BF and BF100kg values and to decrease of AGE100kg values of both gilts and boars at the order of genotypes GG → AG → AA. Calculations performed with additive-dominance model and two-way analysis of variance (ANOVA) showed the faster increasing (decreasing) above-mentioned traits in order of genotypes GG → AG → AA in young boars comparing to gilts. Principal component (PC) analysis showed that first two PCs (PC1 and PC2) determine 76.23 % of variability of the initial matrix for young boars and 82.49 % for gilts. PC1 is highly associated with daily gains during the late growing period (for DG2: r = 0.501 for young boars and 0.896 for gilts) and for the entire growing period (for DG: r = 0.923 and 0.929), whereas PC2 is associated with the daily gains during early growing period (for DG1: r = -0.709 and -0.769). The additive (A) and dominant (D) components of the variability and effects of allele substitution calculated for PC1 were similar for both sexes: А= 0.290, p < 0.001; D= -0.064 — in gilts and А = 0.351, p < 0.001; D= 0.040 — in young boars. We received significant values for PC2 in young boars only for dominant component (А= 0.085; D = 0.177, p < 0.05), whereas in gilts it was only for additive component (А = 0.094, p < 0.001; D = -0.031). The quantitative effects of IGF2 genotypes growing performance on the growth and carcass traits of pigs, and sex-dependent effect of marker genotypes on growing performance of pigs among growing periods should be taken in a point for development of programs of marker-assisted selection utilizing IGF2.
Keywords: pigs, Sus scrofa, large white breed, population, growing performance, QTL, ПЦР, mutation, IGF2.
1ФГБНУ Всероссийский НИИ животноводства
|
Поступила в редакцию |
Оформление электронного оттиска
