doi: 10.15389/agrobiology.2012.6.35rus
УДК 636.42:636.082:577.2:575.174
ОЦЕНКА ВКЛАДА РАЗЛИЧНЫХ ПОПУЛЯЦИЙ В ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ СВИНЕЙ КОРНЯ КРУПНОЙ БЕЛОЙ ПОРОДЫ
Н.А. ЗИНОВЬЕВА1, В.Р. ХАРЗИНОВА1, Е.И. СИЗАРЕВА2, Е.А. ГЛАДЫРЬ1, О.В. КОСТЮНИНА1, С.И. ЛУГОВОЙ3, В.А. ТАПИХА3, Л.Н. ГАМКО4, Е.В. ОВСЕЕНКО4, К.М. ШАВЫРИНА1, Л.К. ЭРНСТ1
С использованием 11 микросателлитов (S0155, S0355, S0386, SW72, SW951, S0101, SW240, SW857, S0228, SW911 и SW936) получена характеристика аллелофонда свиней пород крупная белая и йоркшир. Изучаемая выборка была представлена 17 популяциями животных российской, венгерской, датской, канадской, литовской, немецкой, украинской и французской селекции (n = 837). Обработку данных проводили с помощью программного обеспечения GenAlEx (v. 6.4), Structure (v. 2.3.1) и Past (v. 2.15). Установлено, что 24,2 % общей изменчивости обусловлено межпопуляционными различиями (Rst = 0,242 при p = 0,01). На основании значений индексов Fst и Rst (AMOVA) выявлен наибольший вклад в изменчивость географически удаленных и локальных популяций. Кластерный анализ, проведенный по J.K. Pritchard (2000) и M. Nei (1983), показал, что происхождение популяций отражается в формировании кластеров.
Ключевые слова: свиньи, крупная белая порода, йоркшир, генетическое разнообразие, микросателлиты.
N.A. Zinovieva1, V.R. Kharzinova1, E.I. Sizareva2, E.A. Gladyr'1, O.V. Kostyunina1, S.I. Lugovoi3, V.A. Tapiha3, L.N. Gamko4, E.V. Ovseenko4, K.M. Shavyrina1, L.K. Ernst1
The characteristic of the allele pool of the Large White and Yorkshire pig breeds using 11 microsatellites (S0155, S0355, S0386, SW72, SW951, S0101, SW240, SW857, S0228, SW911 and SW936) was done. The study was performed on 17 pig populations of Russian, Danish, Hungarian, Canadian, Lithuanian, German, Ukrainian and French origins (n = 837). The data were analyzed using GenAlEx (v. 6.4), Structure (v. 2.3.1) and Past (v. 2.15) software. It was shown that 24.2 per cent of the total microsatellite diversity was due to intra population differences (Rst = 0.242, p = 0.01). Based on Fst and Rst (AMOVA) values the greater contribution of geographically distant and local populations into microsatellites diversity was observed. The cluster analysis performed according J.K. Pritchard (2000) and M. Nei (1983) showed that the cluster structure was in concordance with populations' origin.
Keywords: pig, Large White breed, Yorkshire, genetic diversity, microsatellites.
1ГНУ Всероссийский НИИ животноводства |
Поступила в редакцию |