УДК 633.111.1:581.142:631.52:577.21:57.08

ПОЛИМОРФИЗМ МИКРОСАТЕЛЛИТНОГО ЛОКУСА CAMS-336 У СОРТОВ ПЕРЦА И БЛИЗКОРОДСТВЕННЫХ ВИДОВ

Е.А. СНИГИРЬ1, 2,  О.Н. ПЫШНАЯ2,  Е.З. КОЧИЕВА1, 3, Н.Н. РЫЖОВА1

Полиморфизм микросателлитного локуса CAMS-336 исследовали у 45 сортов, гибридов и линий перца Сapsicum annuum L. отечественной и зарубежной селекции, а также у образцов близкородственных культурных видов С. frutescens, C. chinense, C. baccatum. Было обнаружено 6 аллельных вариантов локуса, различающихся по длине, определены частоты встречаемости аллелей. Выявлены уникальные аллели для ряда сортов и видов, вычислены величины PIC (polymorphism information content) для полного набора образцов. Аллельная вариабельность подтверждена прямым секвенированием, что позволило установить точный нуклеотидный состав и размеры обнаруженных аллельных вариантов микросателлитного локуса CAMS-336. Кроме того, секвенирование этого локуса дало возможность определить механизм возникновения новых аллельных вариантов B и D, что связано с точечной заменой Т на А. Полученные данные свидетельствуют о возможности применения микросателлитного локуса CAMS-336 для паспортизации отечественных сортов C. аnnuum.

Ключевые слова: SSR-анализ, Сapsicum аnnuum, паспортизация сортов.

 

Полный текст

 

POLYMORPHISM OF MICROSATELLITE LOCUS CAMS-336 IN PEPPER VARIETIES AND CLOSELY RELATED SPECIES

E.A. Snigir’1, 2, O.N. Pyshnaya2, E.Z. Kochieva1, 3, N.N. Ryzhova1

The polymorphism of microsatellite locus CAMS-336 was investigated in 45 pepper varieties of native and foreign selection, and also in variants of closely related cultivated species of the Сapsicum frutescens, C. chinense, C. baccatum. The authors revealed 6 alleles of this locus, distinguished in length, and determined the frequency of its occurrence. The unique alleles for some varieties and species were isolated and the PIC quantities for complete set of variants were calculated. The allelic variability was confirmed by sequencing, which permitted to determine the accurate nucleotide sequence and the size of revealed alleles of microsatellite locus CAMS-336. In addition, the sequencing of this locus permits to determine the mechanism of appearance of new B and D alleles, notably point substitution of T for A. The obtained data suggests the possibility of the use of microsatellite locus CAMS-336 for issue passports to the native varieties of C. аnnuum L.

Keywords: SSR analysis, Сapsicum аnnuum, cultivar fingerprinting.

1Центр «Биоинженерия» РАН,
117312 г. Москва, просп. 60-летия Октября, 7, корп. 1,
e-mail: ekochieva@yandex.ru;
2ГНУ Всероссийский НИИ селекции и семеноводства
овощных культур Россельхозакадемии,

143080 Московская обл., Одинцовский р-н, п/о Лесной городок,
e-mail:  pishnaya_o@mail.ru;
3ФГОУ ВПО Московский государственный университет им. М.B. Ломоносова,
119899 г. Москва, ГСП-1, Ленинские горы, 1

Поступила в редакцию
19 октября 2010 года

 

Оформление электронного оттиска

назад в начало