Сельскохозяйственная биология, 2014, № 4, с. 35-41.

УДК 636.12/.13:636.082:575.222.5:577.2:575.174

doi: 10.15389/agrobiology.2014.4.35rus

ИНБРИДИНГ И СТЕПЕНЬ ГОМОЗИГОТНОСТИ МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ ЛОКУСОВ У ЛОШАДЕЙ (Equus caballus) ОРЛОВСКОЙ РЫСИСТОЙ ПОРОДЫ

Л.А. ХРАБРОВА, Н.В. БЛОХИНА, А.В. УСТЬЯНЦЕВА

Оценка животных по родословным не позволяет отслеживать фактическое сходство пробанда с предками, в том числе при использовании инбридинга. Общее число определяемых у лошадей маркерных генов уже достигло нескольких сотен, что дает возможность надежно контролировать значительную часть генома животных и использовать генетическую информацию в практической селекции. Ранее мы показали, что у чистокровной верховой породы степень гомозиготности по микросателлитным локусам не имеет прямой зависимости от степени инбридинга в родословной, и самый большой размах вариабельности этого показателя наблюдается в группе инбредных лошадей. В настоящей работе нами было изучено влияние инбридинга на индивидуальном уровне у лошадей орловской рысистой породы. Проведен анализ взаимосвязи между степенью гомозиготности по 16 микросателлитным локусам (AHT4, AHT5, ASB2, ASB17, ASB23, CA425, HMS1, HMS2, HMS3, HMS6, HMS7, HTG4, HTG6, HTG7, HTG10, VHL20) и показателем инбридинга у 1194 особей из 14 хозяйств (ведущие конные заводы и племенные фермы) большинства регионов России (жеребцы-про-изводители — 190 гол., матки — 688 гол., молодняк — 316 гол.). Данные по локусу LEX 3, локализованному в Х-хромосоме, не учитывали, чтобы получить сопоставимые результаты по степени гомо-/гетерозиготности у лошадей разного пола. Было определено, что степень гомозиготности орловских рысаков варьирует в очень широком интервале (от 0 до 75,0 %) и имеет нормальное распределение при положительном коэффициенте асимметрии As = 0,186 и небольшом отрицательном эксцессе Ex = -0, 039. Наибольший разброс показателей степени гомозиготности зарегистрировали в группе лошадей с умеренным инбридингом (F_x = 0,1-1,0 %). Степень гомозиготности аутбредных лошадей также варьировала в широком диапазоне — от 0 (100 % гетерозиготы) до 56,3 %, то есть достигала значений гораздо выше и ниже среднего показателя по популяции. В предыдущих исследованиях такая же закономерность была отмечена у лошадей чистокровной верховой породы. В среднем коэффициент инбридинга у протестированного поголовья составил 1,61 % по Райту и практически не изменился за четыре последних десятилетия. При этом средний коэффициент инбридинга у продуцирующих жеребцов и маток достиг соответственно 1,65 и 1,67 %, у рысистого молодняка — составил 1,45 %. По мере увеличения коэффициента инбридинга степень гомозиготности медленно возрастала во всех половозрастных группах лошадей. Заметное повышение гомозиготности было выявлено только при степени инбридинга 6,10 % и более, то есть на границе инбредной депрессии по хозяйственно полезным признакам. Коэффициент корреляции между степенью гомозиготности микросателлитных локусов и степенью инбридинга составил 0,079, коэффициент регрессии — 0,546. Во всех исследованных группах орловских рысаков отмечалось снижение степени гомозиготности при инбридинге 5,1-6,0 %, что обусловлено применением комплексного инбридинга (на двух предков и более).

Ключевые слова: гомозиготность, инбридинг, микросателлиты, ДНК, орловская рысистая порода лошадей.

Полный текст

INBREEDING AND HOMOZYGOSITY IN ORLOV TROTTER BREED

Evaluation of animals for the pedigree does not track the actual similarity of probands with ancestors, including that when inbreeding is used. The total number of marker genes defined in horses already reached several hundred and enables to control a significant part of the genome of animals and use genetic information in practical breeding. Previously, we showed that Thoroughbred horse degree of homozygosity on microsatellite loci is not directly based on the degree of inbreeding, and the largest scale variability of this indicator is observed in the group of inbred horses. In the present work we investigated the effects of inbreeding in Orlov Trotter breed on an individual level. The analysis was carried out of the relationship between the degree of homozygosity of 16 microsatellite loci (AHT4, AHT5, ASB2, ASB17, ASB23, CA425, HMS1, HMS2, HMS3, HMS6, HMS7, HTG4, HTG6, HTG7, HTG10, VHL20) and an indicator of inbreeding in 1194 individuals from 14 leading horse-breeding studs and farms in Russia, including 19 stallions, 688 mares and 316 foals. Data on he LEX loci 3, localized in X-chromosome, were not taken into account to obtain comparable results on the degree of homo-/heterozygosity in horses of different sex. It has been determined that the degree of homozygosity in Orlov Trotters varies within a wide range (from 0 up to 75.00 %) and has a normal distribution with a positive coefficient of asymmetry As = 0.186 and a small negative excess Ex = -0.039. The most wide variability on homozygosity was indicated in the horses of mild inbreeding (F_x = 0.1-1.0 %). The homozygosity in outbred horses also varied significantly, from 0 (100 % heterozygosity) to 56.30 %, being much more and less than an average index for the population. Previously, we showed the similar trend in the Thoroughbred horses. The average level of inbreeding of the tested horses amounted to 1.61 % by Wright`s inbreeding coefficient (Fx) in 5 generations in pedigrees and in fact remained unchanged over the past four decades. The average inbreeding coefficient in sires and mares reached 1.65 % and 1.67 %, respectively, while in young stock was 1.45 % only. Dynamics of changes in homozygosity with increase of inbreeding coefficient in all sex and age groups of compared horses had unidirectional trend of slowly increasing. A significant rise of the homozygosity degree was noted only at inbreeding coefficient of 6.10 % and more, on the margin of inbred depression for economically valuable traits. The coefficient of correlation between the degree of homozygosity of microsatellite loci and the level of inbreeding was 0.079 with the regression coefficient of 0.546. In all groups, it has been found an evident decline in the degree of homozygosity in Orlov Trotter horses when the inbreeding coefficient reached 5.1-6.0 % due to complex inbreeding, with two or more ancestors used.

Keywords: homozygosity, inbreeding, microsatellite DNA, Orlov Trotter breed.

Оформление электронного оттиска